رغم الظاهر من انجازات القبض على شبكات الموساد الاسرائيلي في لبنان فان هذا الحضور الاسرائيلي يترك آثاراً بالغة الخطورة في الداخل اللبناني. فعلى الصعيد السياسي قال الجنرال عون انه لا يستبعد ارتباط سياسيين بموضوع التعامل مع الإسرائيليين «وهناك من يهربون الى أماكن أخرى غير إسرائيل وقد يكون لهم ارتباط بأشخاص من الصف الأول في الموالاة. وهو ما فسره المحللون بإنتقال "التخوين" من السجالات الى الاتهامات المباشرة. ويتابعون ان الخيار الاسرائيلي كان مطروحاً دائماً في لبنان لكن بروزه بهذا الشكل يتحدى اصحاب الخيارات المعادية لاسرائيل ويعجل بالصدام الاهلي. كما يتابع المحللون باهتمام صراع الاجهزة الامنية اللبنانية على تصدر واجهة كشف هذه الشبكات. علماً بان كشفها انما يعود اما الى مخابرات حزب الله او الى معلومات اجهزة خارجية تعطى لهذا الجهاز اللبناني او ذاك بهدف تظهيره. والأهم ان تورط عدد من كبار الضباط اللبنانيين في التجسس يجعل الثقة الشعبية بالجيش موضوع حذر وتحفظ.